El programa de Doctorado en Neurociencias ofrece posibilidades de desarrollo en todas las siguientes líneas de investigación:

Neurobiología celular y molecular:
Tópicos: neurodesarrollo; neurodegeneración y neuroregeneración; señalización intercelular; procesos inflamatorios; comunicación intercelular; señalización en dolor.

Neurociencia de circuitos y sistemas:
Tópicos: neurotransmisión sináptica; ciclo sueño-vigilia; aminas biogénicas en control conductual
organización tálamo-cortical.

Neurofisiología y Neuroanatomía:
Tópicos: neuroquímica de la adicción; ritmos neuronales y endocrinos; evolución del cerebro;
organización y estructura sináptica.

Neurociencia cognitiva de procesos fisiológicos:
Tópicos: aprendizaje y memoria; estrés; atención; conciencia; meditación; red por defecto; lenguaje; interfaces cerebro-computador.

Neurociencia cognitiva de procesos patológicos:
Tópicos: esquizofrenia; depresión; déficit atencional; epilepsia; parkinson.